操作者：
生物安全柜如果使用不當，其防護作用就可能大大受到影響。
紫外燈：
生物安全柜中不需要紫外燈。如果使用紫外燈的話，應該每周進行清潔，以除去可能影響其殺菌效果的灰塵和污垢。
明火：
在生物安全柜內所形成的幾乎沒有微生物的環(huán)境中，應避免使用明火。
溢出：
實驗室中要張貼如何處理溢出物的實驗室操作規(guī)則，每一位使用實驗室的成員都要閱讀并理解這些規(guī)程。
認證：
在安裝時以及每隔一定時間以后，應由有資質的專業(yè)人員按照生產(chǎn)商的說明對每一臺生物安全柜的運行性能以及完整性進行認證，以檢查其是否符合國家及的性能標準。
清潔和消毒：
由于剩余的培養(yǎng)基可能會使微生物生長繁殖，因此在實驗結束時，包括儀器設備在內的生物安全柜里的所有物品都應清除表面污染，并移出安全柜。
清除污染：
生物安全柜在移動以及更換過濾器之前，必須清除污染。
個體防護裝備：
在使用生物安全柜時應穿著個體防護服。
警報器：
可以在兩種警報器中選擇一種來裝備生物安全柜。